新鲜尿液具有一定的特殊微弱芳香味，它来源于挥发性芳香酸。放置后的尿液可因尿素分解而产生氨臭味。若新鲜尿液即有异常气味或氨臭则属异常，这可作为临床诊断的线索，常见的尿气味异常及可能出现的疾病分述如下：

新鲜尿液有氨臭味是慢性膀胱炎及尿潴留的表现。

尿液有特殊的苹果味是糖尿病酮症的表现。

尿带粪臭或腐臭味则可能是膀胱直(结)肠瘘或膀胱阴道瘘。

有机磷中毒病人的尿液呈蒜臭味。

苯丙酮尿症患者的尿中含苯丙酸，有特殊臭味。

此外，食物、药物如缬草制剂、愈创木脂、二巯基丙醇、艾类等亦可使尿带相应的气味。